UC
GENÉTICA MOLECULAR Y MICROBIOLOGÍA

DE LA IGLESIA CABEZAS,RODRIGO ALONSO

Rodrigo Alonso De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso De La Iglesia Cabezas

Laboratorio: 3542845
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Profesor Asociado

Microbiología Marina

GENÉTICA MOLECULAR Y MICROBIOLOGÍA,
Facultad de Ciencias Biológicas,
Alameda 340, Departamento de Genética Molecular y Microbiología, Facultad de Ciencias Biológicas, Pontificia Universidad Católica de Chile, Santiago, Chile.

Antecedentes Académicos

Doctor (Ciencias Biológicas) , Pontificia Universidad Católica de Chile (2008).
Licenciado (Ciencias Biológicas) , Pontificia Universidad Católica de Chile (2001).

Postdoctorado:

Microbiología Marina, Laboratorio de Procesos Oceanográficos y Clima, Universidad de Concepción

Especialización:

 Microbiología marina. Análisis metagenómicos de comunidades microbianas. Respuestas de comunidades microbianas frente a perturbaciones ambientales

Premios y Distinciones

  • Porfesor Invitado Universidad Paris 6, Universidad Pierre et Marie Curie (2010).

Actividades de Docencia

Pregado
  • 2017 BIO331C-1, Microbiologia Y Biotecnologia Ambiental.
  • 2017 BIO141C-19, Biologia De La Celula.
  • 2017 BIO141C-18, Biologia De La Celula.
Postgrado
  • 2017 BIO4407-1, Biopelículas Y Comportamiento Social En Microorganismos.
  • 2017 BIO4407-1, Biopelículas Y Comportamiento Social En Microorganismos.
  • 2017 BIO4407-1, Biopelículas Y Comportamiento Social En Microorganismos.

Líneas de Investigación

La importancia que tiene los procesos microbiológicos en el océano ha cobrado una relevancia creciente en los últimos años. Los procesos asociados a comunidades de microorganismos marinos son actualmente reconocidos como componentes cruciales de las redes tróficas oceánicas y de los ciclos de nutrientes en el mar. Nuevos descubrimientos en campos como la microbiología marina y la oceanografía microbiana han llevado al refinamiento de conceptos como el “loop-microbiano”, estableciendo que son los microorganismos los responsables de la fijación de casi la mitad del CO2 global y de encausar, por medio de la incorporación de materia orgánica disuelta, una gran fracción de los flujos totales de materia y energía en las tramas tróficas marinas, principalmente a través del componente heterotrófico de dichos organismos. Sin embargo, el conocimiento acerca de los factores que regulan la distribución de los distintos componentes microbianos del ecosistema se encuentra aún en desarrollo. El hecho de que la gran mayoría de los grupos que conforman el Árbol de la Vida sean microorganismos convierte esta tarea en prioritaria para el entendimiento del ecosistema y de la vida misma. Sin embargo, uno de los mayores problemas con los que se debe lidiar en esta área es la dificultad que presenta el aislamiento de microorganismos en le laboratorio. Se estima que alrededor del un 99% de los microorganismos presentes en un sistema determinado no son capaces de crecer en condiciones de laboratorio con las metodologías actualmente disponibles. Si bien se han hecho avances en estas áreas, el desarrollo de herramientas moleculares independientes del cultivo para el análisis de comunidades microbianas complejas ha permitido un enorme avance en el estudio de estos sistemas.

Nuestro laboratorio se enfoca en el análisis de comunidades microbianas marinas y en cómo estas responden frente a perturbaciones ambientales. La herramienta principal de nuestra investigación se basa en el análisis de comunidades microbianas complejas, mediante el análisis del ADN comunitario o metagenómico, tanto por medio de la aplicación de metodologías de secuenciación masiva como mediante el análisis de patrones comunitarios generados a partir de marcadores taxonómicos. Este tipo de aproximaciones permite analizar la información genética presente en el ambiente sin la necesidad de cultivar los organismos en el laboratorio, entregando una visión más completa del sistema.

En este momento nuestro laboratorio esta principalmente enfocado en entender como se ve afectado el componente microbiano en ambientes costeros frente a largas exposiciones a altos niveles de cobre y a variaciones en los niveles de luz, con particular énfasis en el componente fotosintético de dichos sistemas. El tipo de preguntas que buscamos responder son: ¿Qué tipo de microorganismos se ven favorecidos frente a este tipo de perturbaciones? ¿Qué tipo de organismos se ven afectados? ¿Cuáles son las funciones que permiten a los microorganismos vivir en tales condiciones de estrés ambiental?

Por otro lado, nuestro laboratorio se encuentra colaborando en el análisis y anotación de metagenomas marinos, particularmente provenientes del componente eucarionte del plancton de menor tamaño (< 3 µm), también conocidos como picoeucariontes. Esto último está enfocado tanto en el diseño de herramientas que permitan analizar la gran cantidad de datos generados con estas aproximaciones, así como en el análisis de secuencias y anotación de funciones. Estas investigaciones son llevadas a cabo en colaboración con el Laboratorio de Procesos


Titulo: El Mapa De La Disponibilidad De Agua De Niebla En El Desierto De Atacama: Un Modelo Interdisciplinar Con Miras Al Uso De Fuentes Alternativas Y Sustentables En El Norte De Chile
Año: 2017
Concurso e institución: Interdisciplina, UC
Investigador principal: Garcia Barriga Juan Luis
Otros investigadores: Garcia Barriga Juan Luis, Latorre Hidalgo Claudio, De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso, Del Rio Lopez Camilo
Fecha inicio: 01-03-2017
Fecha termino: 01-02-2019
Duración: 23 meses

Titulo: Instituto Milenio En Oceanografía
Año: 2013
Concurso e institución: , Otro
Investigador principal: Ulloa Osvaldo
Otros investigadores: Ulloa Osvaldo, De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Fecha inicio: 01-11-2013
Fecha termino: 01-12-2018
Duración: 61 meses

Titulo: Marcadores Químicos Y Biológicos Para Entender El Crecimiento Acelerado De Ulva Sp. En La Costa De Algarrobo, Chile.
Año: 2011
Concurso e institución: Interdisciplina, UC
Investigador principal: Von Dassow Peter
Otros investigadores: Von Dassow Peter, Giordano Villatoro Ady Iveth, De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Fecha inicio: 01-11-2011
Fecha termino: 01-11-2013
Duración: 24 meses

Titulo: Taxonomic And Functional Responses Of Marine Picophytoplankton Due To Long-Term Copper Perturbations
Año: 2011
Concurso e institución: Regular, CONICYT
Investigador principal: De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Otros investigadores: De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Fecha inicio: 01-03-2011
Fecha termino: 01-03-2014
Duración: 36 meses

Titulo: Diversidad Y Ecología De Comunidades De Eucariontes Fotosintéticos Planctónicos En Aguas Costeras Antárticas: Una Comparación Entre El Verano Y El Invierno Austral
Año: 2010
Concurso e institución: , INACH
Investigador principal: De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Otros investigadores: De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso, Trefault Carrillo Nicole Natalie
Fecha inicio: 01-10-2010
Fecha termino: 01-10-2013
Duración: 36 meses

Titulo: Modificaciones En La Composición De Comunidades Pico Fitoplanctónicas Debido A Una Exposción Prolongada A Altos Niveles De Cobre
Año: 2010
Concurso e institución: Inicio, UC
Investigador principal: De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Otros investigadores: De La Iglesia Cabezas Rodrigo Alonso
Fecha inicio: 10-08-2010
Fecha termino: 10-08-2011
Duración: 12 meses


Publicaciones ISI

1
Identification Of Azadinium Poporum (Dinophyceae) In The Southeast Pacific: Morphology, Molecular Phylogeny, And Azaspiracid Profile Characterization
Autor(es): Tillmann U, Trefault N, Krock B, Parada G, De La Iglesia R, Vasquez M
Año: 2017.39:350-367.
Ref: Tillmann U, Trefault N, Krock B, Parada G, De la Iglesia R, Vasquez M. Identification of Azadinium poporum (Dinophyceae) in the Southeast Pacific: morphology, molecular phylogeny, and azaspiracid profile characterization. Journal Of Plankton Research. 2017;39(2):350-367.

2
Variation In Coastal Antarctic Microbial Community Composition At Sub-Mesoscale: Spatial Distance Or Environmental Filtering?
Autor(es): Moreno M, De La Iglesia R, Valdivia N, Henriquez C, Galan A, Diez B, Trefault N
Año: 2016.92:1-13.
Ref: Moreno M, De la Iglesia R, Valdivia N, Henriquez C, Galan A, Diez B, Trefault N. Variation in coastal Antarctic microbial community composition at sub-mesoscale: spatial distance or environmental filtering?. Fems Microbiology Ecology. 2016;92(7):1-13.

3
Corrosion Of Stainless Steel In Simulated Tide Of Fresh Natural Seawater Of South East Pacific
Autor(es): Fischer D, Daille L, Aguirre J, Galarce C, Armijo F, De La Iglesia R, Pizarro G, Vargas I, Walczak M
Año: 2016.11:6873-6885.
Ref: Fischer D, Daille L, Aguirre J, Galarce C, Armijo F, De la Iglesia R, Pizarro G, Vargas I, Walczak M. Corrosion of Stainless Steel in Simulated Tide of Fresh Natural Seawater of South East Pacific. International Journal Of Electrochemical Science. 2016;11(8):6873-6885.

4
Corrosion Of Stainless Steel In Simulated Tide Of Fresh Natural Seawater Of South East Pacific
Autor(es): Diego A. Fischer, Daille L., Aguirre J., Galarce C., Armijo F, De La Iglesia R., Pizarro G., Vargas I, Walczak M
Año: 2016.11:6873-6885.10.20964/2016.08.50
Ref: Diego A. Fischer, Daille L., Aguirre J., Galarce C., Armijo F, De la Iglesia R., Pizarro G., Vargas I, Walczak M. Corrosion of Stainless Steel in Simulated Tide of Fresh Natural Seawater of South East Pacific. International Journal Of Electrochemical Science. 2016;11:6873-6885.

5
Isolation And Characterization Of An Antarctic Flavobacterium Strain With Agarase And Alginate Lyase Activities
Autor(es): Lavin P, Atala C, Gallardo J, Gonzalez M, De La Iglesia R, Oses R, Torres C, Trefault N, Molina M, Laughinghouse H
Año: 2016.37:403-419.
Ref: Lavin P, Atala C, Gallardo J, Gonzalez M, De la Iglesia R, Oses R, Torres C, Trefault N, Molina M, Laughinghouse H. Isolation and characterization of an Antarctic Flavobacterium strain with agarase and alginate lyase activities. Polish Polar Research. 2016;37(3):403-419.

6
Eukaryotic Picophytoplankton Community Response To Copper Enrichment In A Metal-Perturbed Coastal Environment
Autor(es): Henriquez C, Rodriguez S , Rubio F, Trefault N, Andrade S, De La Iglesia R
Año: 2015.63:189-196.
Ref: Henriquez C, Rodriguez S , Rubio F, Trefault N, Andrade S, De la Iglesia R. Eukaryotic picophytoplankton community response to copper enrichment in a metal-perturbed coastal environment. Phycological Research. 2015;63(3):189-196.

7
Characterization Of Bacterial, Archaeal And Eukaryote Symbionts From Antarctic Sponges Reveals A High Diversity At A Three-Domain Level And A Particular Signature For This Ecosystem
Autor(es): Rodriguez S, De La Iglesia R, Diez B, Fonseca C, Hajdu E, Trefault N
Año: 2015.10:1-19.
Ref: Rodriguez S, De la Iglesia R, Diez B, Fonseca C, Hajdu E, Trefault N. Characterization of Bacterial, Archaeal and Eukaryote Symbionts from Antarctic Sponges Reveals a High Diversity at a Three-Domain Level and a Particular Signature for This Ecosystem. Plos One. 2015;10(9):1-19.

8
Heavy Metal Concentration In Mangrove Surface Sediments From The North-West Coast Of South America
Autor(es): Fernandez-Cadena J, Andrade S, De La Iglesia R
Año: 2014.82:221-226.
Ref: Fernández-Cadena J, Andrade S, De la Iglesia R. Heavy metal concentration in mangrove surface sediments from the north-west coast of South America. Marine Pollution Bulletin. 2014;82(1-2):221-226.

9
Abundance And Diversity Of Copper Resistance Genes Cusa And Copa In Microbial Communities In Relation To The Impact Of Copper On Chilean Marine Sediments
Autor(es): Besaury L, Bodilis J, Delgas F, Andrade S, De La Iglesia R, Ouddane B, Quillet L
Año: 2013.67:16-25.
Ref: Besaury L, Bodilis J, Delgas F, Andrade S, De la Iglesia R, Ouddane B, Quillet L. Abundance and diversity of copper resistance genes cusA and copA in microbial communities in relation to the impact of copper on Chilean marine sediments. Marine Pollution Bulletin. 2013;67(1-2):16-25.

10
Metagenomes Of The Picoalga Bathycoccus From The Chile Coastal Upwelling
Autor(es): Vaulot D, Lepere C, Toulza E, De La Iglesia R, Poulain J, Gaboyer F, Moreau H, Vandepoele K, Ulloa O, Gavory F, Piganeau G
Año: 2012.7:Art. e39648-..
Ref: Vaulot D, Lepere C, Toulza E, de la Iglesia R, Poulain J, Gaboyer F, Moreau H, Vandepoele K, Ulloa O, Gavory F, Piganeau G. Metagenomes of the Picoalga Bathycoccus from the Chile coastal upwelling. Plos One. 2012;7(6):Art. e39648-..

11
Composition Dynamics Of Epilithic Intertidal Bacterial Communities Exposed To High Copper Levels
Autor(es): De La Iglesia R , Valenzuela D , Andrade S, Correa J , Gonzalez B
Año: 2012.79:720-727.
Ref: De la Iglesia R , Valenzuela D , Andrade S, Correa J , Gonzalez B . Composition dynamics of epilithic intertidal bacterial communities exposed to high copper levels. Fems Microbiology Ecology. 2012;79(3):720-727.

12
Marine Photosynthetic Eukaryotes In Polar Systems: Unveiling Phytoplankton Diversity And Composition In Antarctic Waters
Autor(es): De La Iglesia R , Trefault N
Año: 2012.85:435-443.
Ref: De La Iglesia R , Trefault N . Marine photosynthetic eukaryotes in polar systems: Unveiling phytoplankton diversity and composition in Antarctic waters. Revista Chilena De Historia Natural. 2012;85(4):435-443.

13
Novel Polymerase Chain Reaction Primers For The Specific Detection Of Bacterial Copper P-Type Atpases Gene Sequences In Environmental Isolates And Metagenomic Dna
Autor(es): De La Iglesia R, Valenzuela-Heredia D, Pavissich Jp, Freyhoffer S, Andrade S, Correa Ja, Gonzalez B
Año: 2010.50:552-562.
Ref: De la Iglesia R, Valenzuela-Heredia D, Pavissich JP, Freyhoffer S, Andrade S, Correa JA, González B. Novel polymerase chain reaction primers for the specific detection of bacterial copper P-type ATPases gene sequences in environmental isolates and metagenomic DNA. Letters In Applied Microbiology. 2010;50(6):552-562.

14
Metabolic Reconstruction Of Aromatic Compounds Degradation From The Genome Of The Amazing Pollutant-Degrading Bacterium Cupriavidus Necator Jmp134
Autor(es): Perez-Pantoja D, De La Lglesia R, Pieper D, Gonzalez B
Año: 2008.32:736-794.
Ref: Pérez-Pantoja D, De la lglesia R, Pieper D, González B. Metabolic reconstruction of aromatic compounds degradation from the genome of the amazing pollutant-degrading bacterium Cupriavidus necator JMP134. Fems Microbiology Reviews. 2008;32(5):736-794.

15
Changes In Bacterial Community Structure Associated With Coastal Copper Enrichment
Autor(es): Moran A, Hengst M, De La Iglesia R, Andrade S, Correa J, Gonzalez B
Año: 2008.27:2239-2245.
Ref: Morán A, Hengst M, De la Iglesia R, Andrade S, Correa J, González B. Changes in bacterial community structure associated with coastal copper enrichment. Environmental Toxicology And Chemistry. 2008;27(11):2239-2245.

16
Biologically Induced Corrosion Of Copper Pipes In Low-Ph Water
Autor(es): Reyes A, Letelier M, De La Iglesia R, Gonzalez B, Lagos G
Año: 2008.61:135-141.
Ref: Reyes A, Letelier M, De la Iglesia R, González B, Lagos G. Biologically induced corrosion of copper pipes in low-pH water. International Biodeterioration & Biodegradation. 2008;61(2):135-141.

17
Soil Bacteria Are Differentially Affected By The Resin Of The Medicinal Plant Pseudognaphalium Vira Vira And Its Main Component Kaurenoic Acid
Autor(es): Gil F, De La Iglesia R, Mendoza L, Gonzalez B, Wilkens M
Año: 2006.52:10-18.
Ref: Gil F, De la Iglesia R, Mendoza L, González B, Wilkens M. Soil Bacteria Are Differentially Affected by the Resin of the Medicinal Plant Pseudognaphalium Vira Vira and Its Main Component Kaurenoic Acid. Microbial Ecology. 2006;52(1):10-18.

18
Molecular And Population Analyses Of A Recombination Event In The Catabolic Plasmid Pjp4
Autor(es): Larrain-Linton J, De La Iglesia R, Melo F, Gonzalez B
Año: 2006.188:6793-6801.
Ref: Larraín-Linton J, De la Iglesia R, Melo F, González B. Molecular and Population Analyses of a Recombination Event in the Catabolic Plasmid Pjp4. Journal Of Bacteriology. 2006;188(19):6793-6801.

19
Factors Influencing The Composition Of Bacterial Communities Found At Abandoned Copper-Tailings Dumps
Autor(es): De La Iglesia R, Castro D, Ginocchio R, Van Der Lelie D, Gonzalez B
Año: 2006.100:537-544.
Ref: De la Iglesia R, Castro D, Ginocchio R, Van Der Lelie D, González B. Factors Influencing the Composition of Bacterial Communities Found At Abandoned Copper-Tailings Dumps. Journal Of Applied Microbiology. 2006;100(3):537-544.

20
Genetic Organization Of The Catabolic Plasmid Pjp4 From Ralstonia Eutropha Jmp134 Reveals Mechanisms Of Adaptation To Chloroaromatic Pollutants And Evolution Of Specialized Chloroaromatic Degradation Pathways
Autor(es): Trefault N, De La Iglesia R, Molina A, Manzano M, Ledger R, Perez-Pantoja D, Sanchez M, Stuardo M, Gonzalez B
Año: 2004.6:655-668.
Ref: Trefault N, De la Iglesia R, Molina A, Manzano M, Ledger R, Perez-Pantoja D, Sánchez M, Stuardo M, González B. Genetic Organization of the Catabolic Plasmid Pjp4 From Ralstonia Eutropha Jmp134 Reveals Mechanisms of Adaptation to Chloroaromatic Pollutants and Evolution of Specialized Chloroaromatic Degradation Pathways. Environmental Microbiology. 2004;6(7):655-668.

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