Estudiante de doctorado es seleccionada para participar en workshop internacional del Instituto Allen
julio 28, 2026
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Paula Amado fue una de las 18 personas seleccionadas, entre más de 200 postulantes, para ser parte del curso "2026 Computational Cell Types Workshop”, que se realizó en Seattle, EEUU.
Paula fue una de las 18 personas seleccionadas, entre más de 200 postulantes, para ser parte de este curso realizado en Seattle, Estados Unidos. El workshop tuvo como objetivo enseñar el uso de técnicas ómicas de célula única y de transcriptómica espacial aplicadas a distintas preguntas relacionadas con la salud cerebral.
Su participación fue posible gracias a un proyecto vinculado con su tesis doctoral, que estudia cómo el envejecimiento afecta al sistema dopaminérgico y si la manipulación de proteínas de la dinámica mitocondrial puede evitar su deterioro en el envejecimiento.
“Mi intención era participar para ganar más herramientas y poder incluirlas en mi tesis”, cuenta.
Seattle, Estados Unidos. Foto: Paula Amado
Un acercamiento al análisis transcriptómico
El año pasado, la estudiante del Doctorado en Ciencias Biológicas UC comenzó a explorar nuevas herramientas que pudieran aportar a su tesis más allá del trabajo experimental. Fue así como llegó al análisis computacional, aprovechando datos públicos sobre el envejecimiento en moscas. “Empecé a adentrarme en el análisis transcriptómico en moscas y me di cuenta que habían datos que yo podía sacar, que aportan a la tesis”.
¿Qué muestran estos datos? La expresión de genes a lo largo del envejecimiento. En ese sentido, Paula explica que “en mi caso, voy a ver los genes específicos, que están asociados a mi tesis, que son de dinámica mitocondrial. Además, ellos tienen datos de transcriptómica espacial que no es solo ver el transcrito de ARN, sino que en qué parte específica del cerebro se expresa. Por tanto, como a mi me interesan, específicamente, las neuronas dopaminérgicas, puedo ver las neuronas o ver esta expresión de genes de neuronas dopaminérgicas, pero además dividirlos por áreas del cerebro”.
Durante el curso, junto a sus compañeras y compañeros, conoció los conjuntos de datos de transcriptómica espacial y de célula única desarrollados por el Instituto Allen y sus colaboradores. Además, trabajaron en equipos para utilizarlos en distintos análisis, la creación de herramientas y el desarrollo de modelos, entre otras aplicaciones.
Para Paula Amado, el workshop representó un primer acercamiento de cuatro días a este tipo de información: “Nunca me había enfrentado a este tipo de datos y el curso me sirvió para este primer acercamiento”.
“Nos enseñaron a trabajar con las bases de datos públicas del Instituto Allen”, detalla. A lo que agrega: “Creo que lo que más me sirvió es haberme enfrentado a trabajar con algo tan masivo, no puedo decir que soy experta en análisis transcriptómico, pero sí le perdí el miedo a trabajar con estos datos gracias a las herramientas que me entregaron. Entonces, fue una experiencia super valiosa la que gané”.
A su regreso a Chile, Paula compartió con sus compañeras y compañeros del Laboratorio de Neurogenética de la Conducta, liderado por el profesor Jorge Campusano, los conocimientos adquiridos en el Instituto Allen. También, les mostró la información disponible a la que continúa teniendo acceso. “En el lab nos estamos acercando al mundo de la transcriptómica”, afirma.
Foto: Paula Amado
Foto: Paula Amado
El programa de Doctorado en Ciencias Biológicas
La mención Biología Celular y Molecular del Doctorado en Ciencias Biológicas UC, que integra Paula Amado, se dedica desde 1970 al estudio de las bases celulares y moleculares de diversos procesos biológicos, entre ellos, la regulación de la expresión del genoma, el tráfico de proteínas, el funcionamiento de organelos, las interacciones célula-célula, la proliferación de células madre y la diferenciación, mantención y envejecimiento celular.
Para Paula sus años siendo parte de la mención han sido un proceso marcado por aprendizajes y desafíos. “Ha sido de subidas y bajadas, pero en mi laboratorio hay una red de apoyo super importante, entonces, agradezco mucho lo que se ha generado ahí”.
Asimismo, destaca el trabajo de la Dirección de Postgrado y del equipo académico: “Creo que las herramientas que da el programa, si bien siempre pueden ser mejores, al menos la calidad humana que hay en la dirección es muy relevante, eso es algo que no se encuentra en todas partes. Además, la relación con mis propios compañeros de la mención es invaluable, cuando uno trabaja en ciencia, lo colaborativo es importante”.
